因为通常情况下我们得到的数据是以我们自认为的方法进行衡量测定的，那么转换之后的数据可以认为我们换了一把衡量数据的标尺或者单位，例如 log transformed data 就可以被看作是我们本来就是利 …

线性化关系：对数变换可以将非线性关系 → \rightarrow 线性关系，使线性模型（如OLS）能够更好地 拟合数据 比例变化：对数变换后，模型的系数可以解释为 百分比变化， 直接反映了变量之间的相对变 …

事实上，其实是我们对数据进行了 对数转换 （log transformation），也就是我们常说的取log。 通常使用以10为底（log10）、以2为底（log2）和 自然对数 （loge）。

Centered log-ratio (clr) transformation and robust principal component analysis of long-term NDVI data reveal vegetation activity linked to climate processes. Climate, 3 (1), 135-149.

# The point of these two transformations, the VST and the rlog, is to remove the dependence of the variance on the mean, particularly the high variance of the logarithm of count data when the mean is …

Negative values that frequently result from background correction of low-intensity signals have to be reset before taking the logarithm, and thus they are artificially truncated.

为了方便下游分析，DESeq2提供两种数据标准化方法: VST (variance stabilizing transformations)和 rlog (regularized logarithm)。

相比之下，伪对数 (Pseudo-Logarithm)修正了经典对数的这一限制：它对所有实数都有定义，对于大绝对值使用带符号的对数，并在底数趋近于零时平滑过渡到零。

函数rlog代表正则化log转换，通过拟合一个模型，将每个样本的一个项和一个根据数据估计的系数的先验分布进行拟合，将原始计数数据转换为log2尺度。

1、对数转换 Logarithmic Transformation 在对数转换中，我们将使用 NumPy 将 log 应用于所有特征值，并将其存储在新特征中。 从图中可以看到使用对数转换似乎不太适合这个数据集，它甚至会使数 …